Jiménez de Gregorio, F. (1999) en su estudio, Materiales para una toponimia de la provincia de Toledo (Uno), nos presenta este topónimo:
JAEÑA S. de -el nombre dado a esta sierra se documenta en el año 1756, con la versión de Jaena, derivado de Zahéna, Zahén, que significan 'dobla y media o jaena', moneda acuñada a mediados del siglo XVI en Tremecén, departamento de Orán hoy, por el reyezuelo Abú Zaiyán Ahmed, quien reinó en dos veces, la primera de 1540 a 1543 y la segunda de 1544 al 1550; por lo expuesto, el significado sería 'sierra de las doblas'